Кафедра военной эпидемиологии и военной гигиены военно-медицинского факультета в учреждении образования «Белорусский государственный медицинский университет» была образована в 1995 году.
Первоначально кафедра располагалась по ул. Ленинградской, д. 12, а с 1998 года размещается в учебном корпусе УО «БГМУ» № 2 по пер. Асаналиева, д. 5.
История кафедры военной эпидемиологии и военной гигиены началась с открытия 6 июня 1995 года военно-медицинского факультета в Минском государственном медицинском институте.
С 1995 по 2007 гг. кафедру военной эпидемиологии и военной гигиены возглавлял кандидат медицинских наук, доцент, полковник медицинской службы Дорошевич Вячеслав Иванович. Под его руководством проходило становление кафедры: формировался профессорско-преподавательский состав, разрабатывались учебные планы и программы, создавалась учебно-материальная база. С 2008 по 2011 гг. начальником кафедры был кандидат медицинских наук, доцент, полковник медицинской службы Глебов Андрей Николаевич. С 2012 по 2015 гг. кафедрой руководил полковник медицинской службы Лебедев Сергей Михайлович. С 2015 по 2022 гг. начальником кафедры был кандидат медицинских наук, доцент, полковник медицинской службы Ширко Дмитрий Игоревич. В настоящее время кафедрой руководит полковник медицинской службы Баканов Игорь Сергеевич.
Преподавателями кафедры в разное время работали: заместитель начальника кафедры полковник медицинской службы Варашкевич Ю.Ю. (1995-2004), ст. преп. Строганов В.Н. (1995-2000), ст. преп. Крайний В.А. (1997-1998), ст. преп. Павлов А.В. (1997-2004), ст. преп. Федоров П.П. (1997-1999), доцент кафедры канд. мед. наук Бацукова Н.Л. (1998-2001), ст. преп. Гулякевич В.Н. (1999-2002), профессор кафедры канд. мед. наук Борушко Н.В. (2001-2006), доцент кафедры канд. мед. наук Сущевич В.В. (2003-2005), ст. преп. майор медицинской службы Авраменко М.Ю. (2005-2006), ст. преп. Самохин Д.А. (2002-2014), ст. преп. подполковник медицинской службы Белоногов И.А., заместитель начальника кафедры подполковник медицинской службы Вашетко С.А. (2017-2023).
На кафедре проводится работа по совершенствованию учебно-воспитательного процесса. С этой задачей успешно справляется профессорско-преподавательский состав кафедры. Преподаватели сохраняют и творчески развивают традиции и подходы к организации учебного процесса, направления научных исследований на кафедре, которые посвящены гигиенической оценке фактического питания, изучению адаптационных возможностей организма и факторов риска в оценке состояния здоровья военнослужащих. Cотрудники кафедры военной эпидемиологии и военной гигиены бережно сохраняют и преумножают научное наследие своих учителей, идеи гуманизма и безграничной преданности своему делу, вносят посильный вклад в развитие медицинской науки и подготовки военно-медицинских кадров в стране.