Впервые попытка открытия санитарно-гигиенического факультета в Минском государственном медицинском институте была предпринята в 1931 году (деканом факультета стал Иван Моисеевич Стельмашонок). В 1934 году в институте были закрыты все факультеты, кроме лечебного, однако уже в 1938-м санитарно-гигиенический факультет был восстановлен и успешно функционировал до начала Великой Отечественной войны.
В послевоенные годы врачебные кадры для санитарно-эпидемиологической службы Беларуси готовились на санитарно-гигиенических факультетах медицинских институтов других республик по направлению Министерства здравоохранения БССР. Однако это не в полной мере решало проблему кадров для санитарно-эпидемиологической службы. Послевоенная разруха и неблагоприятная санитарно-эпидемиологическая обстановка диктовали необходимость подготовки собственных специалистов этого профиля.
В 1964 году приказом министра здравоохранения БССР И. А. Инсарова было предписано создание в структуре Минского государственного медицинского института санитарно-гигиенического факультета с приемом на первый курс 100 студентов. Так началась современная история факультета. Первым деканом стал участник Великой Отечественной войны, комиссар партизанского отряда, доцент кафедры общей гигиены Владимир Степанович Сенчук (1964–1971), на плечи которого легла огромная организационная, кадровая и методическая работа. Большую помощь в размещении ряда кафедр и обеспечении работниками нового факультета оказали профильные республиканские научно-практические центры.
В последующем деканами факультета были: профессор кафедры инфекционных болезней Пётр Леонтьевич Новиков (1971–1974), доцент кафедры социальной гигиены и организации здравоохранения Михаил Кононович Зубрицкий (1974–1979), доцент кафедры микробиологии, вирусологии и иммунологии Леонид Иванович Каскевич (1979–1985), профессор кафедры биоорганической химии Иосиф Витольдович Романовский (1985–2007), доцент кафедры радиационной медицины и экологии Арам Рубенович Аветисов (2007–2014), доцент кафедры инфекционных болезней Юрий Леонидович Горбич (2014–2017).
С 2018 года факультет возглавляет доцент кафедры гигиены труда Андрей Владимирович Гиндюк. В разные годы заместителями деканов факультета работали профессора И. А. Чаховский, А. Д. Таганович, В. П. Филонов, доценты Г .В. Лавриненко, Л. И. Глинник, П. Г. Новиков, Д. А. Черношей, Я. Н. Борисевич, старшие преподаватели О. А. Кульпанович, Т. В. Сухорукова, а с 2016 года – доцент кафедры патологической физиологии Ирина Валентиновна Сысоева.
В 1991 году санитарно-гигиенический факультет был переименован в медико-профилактический. При этом претерпели изменения не только название факультета, но и система, технология и методология подготовки специалистов, связанные с расширением задач и основных видов деятельности врача медико-профилактического профиля на новом этапе развития Республики Беларусь.
Профессорско-преподавательским составом факультета накоплен значительный научно-практический и методический опыт подготовки специалистов профилактической медицины.
Гордость факультета – крупнейшие ученые-медики Беларуси, работавшие (академик АН БССР А.Я. Прокопчук, член-корреспондент Академии медицинских наук СССР, профессор З.К. Могилевчик, академик НАН Беларуси, профессор Л.П. Титов, Заслуженный врач Республики Беларусь А.А. Астапов, профессора Б.Я. Эльберт, П.В. Остапеня, Д.П. Беляцкий, А.П. Красильников, Н.И. Лебедев, И.А. Чаховский, А.А. Адарченко, Н.Т. Лебедева, Д.В. Полешко, Г.Л. Бородина, П.Л. Новиков, В.К. Кухта, Т.С. Морозкина, Л.А. Олешкевич, М.Н. Ломако, Х.Х. Лавинский, Г.Н. Чистенко) и работающие на профильных кафедрах (член-корреспондент НАН Беларуси, профессор И.А. Карпов, профессора Е.О.Гузик, Д.Е.Данилов, М.Л.Доценко, С.В.Жаворонок, А.А.Ключарева, В.С. Коровкин, А.Н.Лаптев, Е.А.Лаптева, О.В.Панкратов, А.С.Позднякова М.И. Римжа, О.Н.Романова, А.Н.Стожаров).
Медико-профилактический факультет сегодня представлен десятью кафедрами, из которых шесть профильных (общей гигиены, гигиены труда, гигиены и охраны здоровья детей с курсом повышения квалификации и переподготовки, эпидемиологии, радиационной медицины и экологии, микробиологии, вирусологии, иммунологии) и четыре клинических (пульмонологии, фтизиатрии, аллергологии и профпатологии с курсом повышения квалификации и переподготовки, дерматовенерологии и косметологии с курсом повышения квалификации и переподготовки, детских инфекционных болезней с курсом повышения квалификации и переподготовки, инфекционных болезней с курсом повышения квалификации и переподготовки), на которых студенты проходят углубленную специализированную подготовку по специальности. На кафедрах факультета также повышают свою квалификацию и проходят переподготовку врачи в рамках реализации образовательных программ дополнительного образования взрослых в отрасли.
Общее число обучающихся студентов за время существования факультета неоднократно изменялось: в 1970 году на факультете занимались 606 студентов, в 1990-м – 476, в 2001-м – 483 (421 студент – на бюджетной форме обучения и 62 – на платной основе), в 2020-м – 527 (371 студент – на бюджетной форме обучения и 160 – на платной основе), в 2025-2026 году на факультете обучается 672 студента (559 студент – на бюджетной форме обучения и 113 – на платной основе).
За все время своего существования факультет подготовил порядка 5000 врачей. Эти специалисты весьма востребованы в отрасли: в 2018 году на 87 выпускников подано более 150 заявок от организаций здравоохранения, а в 2024 году на 101 выпускника было заявлено более 260 мест.
Выпускники медико-профилактического факультета Белорусского государственного медицинского университета могут работать по следующим направлениям: гигиена, эпидемиология и профилактика (врач-гигиенист, врач-эпидемиолог, врач по медицинской профилактике), лабораторные исследования (врач-лаборант), клиническая/госпитальная эпидемиология (врач-клинический эпидемиолог), судебная медицина, организация здравоохранения, заниматься научными исследованиями и осуществлять преподавательскую деятельность в университетах и РНПЦ.
Сегодня выпускники медико-профилактического факультета БГМУ работают во всех звеньях санитарно-эпидемиологической службы: в Министерстве здравоохранения Республики Беларусь, НИИ гигиены, токсикологии, эпидемиологии, вирусологии и микробиологии государственного учреждения «Республиканский центр гигиены, эпидемиологии и общественного здоровья», областных, городских, зональных и районных центрах гигиены и эпидемиологии, на кафедрах медицинских университетов Республики Беларусь, Института повышения квалификации и переподготовки кадров здравоохранения БГМУ (ИПКиПКЗ), в других научно-исследовательских институтах и лабораториях.
Специалисты профилактической медицины востребованы и далеко за пределами Республики Беларусь.
Студенческие годы не ограничиваются только учебой. Будущий врач может проявить свои таланты и скрытые резервы в спорте, на сцене, в клубах по интересам, в волонтерской деятельности. Заметки студентов публикуются в официальном телеграмм-канале БГМУ и факультета, университетской газете «Веснiк БДМУ», будущие врачи гордятся своими достижениями на спортивных универсиадах и республиканских конкурсах художественной самодеятельности. На факультете активно работает творческий коллектив «Резонанс».