Кафедра хирургии Белорусского государственного института усовершенствования врачей (БелГИУВ) самая первая в системе развития усовершенствования врачей. Образование ее предшествовало официальному открытию института в 1931 г., до этого курсовое усовершенствование хирургов проводили на базе факультета БГУ и мединститута.
После официального открытия БелГИУВ первым заведующим кафедрой стал С.М. Рубашов. Его непосредственными учениками-сотрудниками были В.В. Бабук, И.М. Стельмашонок. Е.В. Корчиц – второй заведующий кафедрой (1934 – 1941), член-корреспондент АН БССР, родоначальник онкологии и противозобной службы. Его ассистентами были в те времена А.А. Грейман, Н.И. Бобрик. В 1949 г. кафедру возглавил П.Н. Маслов, который через несколько месяцев перешел на работу в Минский медицинский институт. С 1949 по 1953 гг. кафедру возглавлял профессор В.О. Морзон – самобытный белорусский хирург, прошедший путь от рядового сельского хирурга до профессора. После его смерти кафедра переехала во вновь построенный корпус Минской областной клинической больницы по ул. Подлесной.
С 1954 по 1963 гг. кафедрой заведовал А. М. Болдин. Основными направлениями деятельности клиники оставалась абдоминальная хирургия, зарождались направления грудной хирургии, анестезиологии. В это время на кафедре работали: доцент 3.Е. Лившиц, О.С. Мишарев, В.И. Шиманская, А.А. Плавинский, Н.А. Тищенко. С 1963 по 1965 гг. исполнял обязанности заведующего кафедрой доцент 3.Е. Лившиц. С 1965 по 1975 гг. кафедрой заведовал Заслуженный деятель науки, профессор И.Б. Олешкевич. В это время О.С. Мишарев защитил докторскую диссертацию и перешел на кафедру грудной хирургии (впоследствии детской хирургии). Н.А. Тищенко стал сотрудником кафедры онкологии. Кафедра была переименована в кафедру хирургии и анестезиологии. В таком статусе она просуществовала до 1968 г., когда вновь открытую кафедру анестезиологии и реаниматологии возглавил доктор медицинских наук, профессор И.3. Клявзуник. Таким образом, кафедра хирургии была основой 3х вновь созданных кафедр — онкологии, грудной хирургии (впоследствии детской хирургии), анестезиологии и реаниматологии.
Кафедра хирургии с 1971г. базируется на вновь открытой вначале Республиканской, а затем Минской областной клинической больнице. С 1975 по 1977 гг. кафедрой хирургии заведовал доктор медицинских наук В.Г. Астапенко, особое внимание уделявший неотложной хирургии. С 1977 г. по 2002 г. кафедрой заведовал доктор медицинских наук, профессор, Заслуженный деятель науки БССР, Лауреат Государственной премии Республики Беларусь, академик БелАМН и АМН Украины И.Н. Гришин, который продолжил лучшие традиции кафедры. В то время титул кафедры был изменен — она стала кафедрой клинической и экспериментальной хирургии, что полнее отражало суть работы, поскольку на ней работали специализированные республиканские центры: хирургии сосудов, микрохирургии, проктологии, абдоминальной и гнойной хирургии, эндоскопических методов диагностики и хирургического лечения. Кафедра расширена за счет организации курсов сердечно-сосудистой хирургии (заведующий - д.м.н., Лауреат Государственной премии Республики Беларусь Ю.П. Островский) и топографической анатомии (профессор А.Ф. Рылюк). На кафедре к 2000 году работали 6 докторов медицинских наук, 3 — Лауреата Государственной премии, 5 доцентов, 2 профессора.
С 1993 по 1997 гг. в Беларуси создана сеть Республиканских (2) и региональных (5) реабилитационных кабинетов стомийной помощи, на учете в которых на 2005 год состояло более 5000 инвалидов с энтеро- и колостомами.
В 2002–2022 гг. кафедру возглавлял доктор медицинских наук, профессор А.В. Воробей. В связи с реорганизацией работы БелМАПО в 2003 году кафедра переименована в кафедру хирургии и топографической анатомии, а с марта 2006 года – в кафедру хирургии. Таким образом, к 75-летию БелМАПО на основной базе кафедры (Минская областная клиническая больница), курсах топографической анатомии (ЦНИЛ БелМАПО) и сердечно-сосудистой хирургии (РНПЦ «Кардиология») работали 8 докторов мед. наук, из них 6 профессоров (И.Н. Гришин, А.В. Воробей, А.Ф. Рылюк, Ю.П.Островский, Н.Н.Чур, В.Н. Подгайский); доценты – В.В. Климович, И.А. Давидовский, Г.П. Кузуров; ассистенты – Е.И. Вижинис, М.Г. Ивашко; лаборанты: Р.А. Мисовец, Г.С. Гринкевич, А.Г. Лапчинская. С середины 2006 года на кафедру поочередно были приняты сотрудники, защитившие кандидатские диссертации на кафедре хирургии: Воевода М.Т. (2006), Лурье В.Н. (2008), Шулейко А.Ч. (2010), ассистенты: Орловский Ю.Н. (2011), Попель Г.А. (2012), Махмудов А.М. (2012). Профессор Островский Ю.П. с 2007 года возглавил вновь созданную кафедру кардиохирургии с курсом трансплантологии. Профессор Подгайский В.Н. с 2014 г. возглавил вновь созданную кафедру пластической хирургии и комбустиологии, и к настоящему времени в клинике произведено более 1720 реплантаций сегментов конечностей. В 2011 году профессор А.В. Воробей организовал и возглавил Белорусский панкреатологический клуб, включенный в 2013 году как национальное объединение в состав Европейского панкреатологического клуба. 14 ноября 2014 года профессор А.В. Воробей избран членом-корреспондентом Национальной академии наук Беларуси.
В ноябре 2022 г. кафедру хирургии возглавил доктор медицинских наук, доцент А.Ч. Шулейко. Основные направления деятельности: лапароскопическая и эндоскопическая малоинвазивная хирургия, лазерные технологии в хирургической гастроэнтерологии и колопроктологии, эстетической флебологии; интервенционная радиология и гибридная хирургия при заболевании периферических артерий и вен; малоинвазивная хирургия при патологии гастродуодено-панкреатобилиарной зоны; клеточная терапия и реконструктивно-восстановительные операции при сосудистых и воспалительных заболеваниях кишечника.
В период 2002-2024 гг. сотрудниками кафедры подготовлены более 21 монографии и практических руководств по различных разделам хирургии, получено более 20 патентов на изобретения, защищены 1 докторская (панкреатология) и 19 кандидатских диссертаций: в области колопроктологии (9), экстренной хирургии (3), торакальной хирургии (1), билиарной хирургии (1), хирургической гематологии (1), эндоскопии (2), колоректальному раку (1),сосудистым мальформациям (1). Разработаны и научно обоснованы патогенетические методы хирургической коррекции хронического колостаза при долихоколон и левосторонней опухолевой толстокишечной непроходимости, абдоминалгии при хроническом панкреатите, болезни Гиршпрунга у взрослых, синдроме компрессии чревного ствола, болезни Крона и язвенном колите.
Монографии и практические руководства: «Реабилитация стомированных больных», «Энтеро- и колостомия», «Колоректальный рак», «Болезнь Гиршпрунга у взрослых», «Диагностика и лечения болезни Гиршпрунга у взрослых», «Оперативная хирургия с топографической анатомией органов брюшной полости», «Хирургические аспекты долихоколон», «Хирургия язвенной болезни желудка», «Неязвенные гастроинтестинальные кровотечения», «Стриктуры гепатикоеюноанастомозов», «Глубокие флегмоны шеи и перфорация пищевода осложненная медиастинитом», «Холецистэктомия», «Повреждения желчевыводящих путей», «Высокие повреждения и стриктуры печеночных протоков», «Хирургия поджелудочной железы», «Кисты, свищи поджелудочной железы и их осложнения», «Грыжи пищеводного отверстия диафрагмы и рефлюксная гастроэзофагеальная болезнь», «Дуоденоеюнопластика», «Функциональные и органические стеноза пилородуоденального канала», «Кардиоспазм, ахалазия кардии и перфорация пищевода», «Клиническая ангиология и ангиохирургия», «Повреждения магистральных кровеносных сосудов», «Разрывы аневризм брюшной аорты и их лечение», «Варикоз и варикозная болезнь нижних конечностей», «Трофические язвы нижних конечностей», «Ложные аневризмы после реконструктивных операций на брюшной аорте», «Венозный тромбоз», «Синдром компрессии чревного ствола».
В 2023 г. произошло слияние ГУО «БелМАПО» и УО «БГМУ», кафедра хирургии вошла в состав Института повышения квалификации и переподготовки кадров здравоохранения. С 1 июля 2024 г. кафедра переименована в кафедру хирургии и эндоскопии.
На январь 2025 г. на кафедре работают: 1 профессор (д.м.н. Шахрай С.В.); 7 доцентов (д.м.н. Шулейко А.Ч., к.м.н. Давидовский И.А., к.м.н. Вижинис Е.И., к.м.н. Лагодич Н.А., к.м.н. Гаин М.Ю., к.м.н. Хаджи-Исмаил И.М., к.м.н. Боровик Е.А.); 3 преподавателя и ассистента (Дыбов О.Г., Бут-Гусаим Г.В., Гусева Д.О.); 2 ведущих лаборанта (Рымонт Е.И., Бушкевич Н.А.); 1 очный аспирант (Тимошенко К.Н.).
На январь 2026 г. на кафедре работают: 2 доктора медицинских наук (Шулейко А.Ч. – заведующий кафедрой, Шахрай С.В. – профессор кафедры); 10 кандидатов медицинских наук (доцент Давидовский И.А., доцент Вижинис Е.И., доцент Лагодич Н.А., доцент Хаджи-Исмаил И.М., доцент Гаин М.Ю., доцент Бонцевич Д.Н., Боровик Е.А., Матвеева Е.А., Дыбов О.Г., Бут-Гусаим Г.В.); 2 ассистента (Гусева Д.О., Лаевская М.Н.); 1 ведущий лаборант (Рымонт Е.И.); 1 очный аспирант (Тимошенко К.Н.).