Обучение слушателей вопросам экономики здравоохранения в виде единичных лекций или разделов учебных программ началось проводится в БелГИУВ с начала 50-х годов ХХ века. Это направление обучения развивалось с начала 50-х годов ХХ века. Кадровый состав БелГИУВ в данный период включал в себя ведущих организаторов здравоохранения, высококвалифицированных специалистов-практиков: Доросинский А.Л., Обловацкая А.Ф. (бюджет и финансирование здравоохранения), Школьников В.О. (организация хозяйственного обслуживания). Они работали в БелГИУВ в виде совместительства или на условиях почасовой оплаты. Также лекции читали ведущие специалисты Министерства здравоохранения БССР: Гиткин Семен Аронович (1891, Паневежис Ковенской губ.—1984, Минск) (бюджет и финансирование здравоохранения), Махнач Владимир Михайлович (1912—1970, Минск) заместитель начальника планово-финансового управления МЗ БССР, Мовчан Клавдия Анатольевна (1949, д. Синило Минского р-на Минской обл. — 2012, Минск) начальник Главного управления прогнозирования и экономики Минздрава РБ, 1995—2007.
В дальнейшем лекции и практические занятия по экономике здравоохранения читали сотрудники кафедры организации здравоохранения: профессор Вальчук Э.А., старшие преподаватели Федоров Н.И., Соколов А.Ю. и другие преподаватели.
С 2000 г. в БелМАПО официально началось системное и целостное преподавание экономики здравоохранения. Курс «Экономика и бухгалтерский учет в здравоохранении» организован на основании решения коллегии Министерства здравоохранения РБ 22.02.2000 г. № 3 при кафедре социальной гигиены, экономики и управления здравоохранения. Первая учебная программа по бухгалтерскому учету в здравоохранении разработана преподавателями курса и утверждена Министром здравоохранения Республики Беларусь Зеленкевичем И.Б. Первый цикл состоялся в ноябре 2000 г.
Создание данного курса продиктовано самой жизнью. Именно экономическая составляющая является базовым компонентом здравоохранения. Она определяет логику, характер и эффективность развития отрасли. ВОЗ уделяет большое внимание ее развитию. Финансы – это один из главных факторов, который задает векторное направление здравоохранения. Поэтому вопросы экономического обеспечения деятельности учреждений отрасли приобретают ключевое значение.
Кафедры экономики здравоохранения имеются практически во всех медицинских университетах, а также академий последипломного образования стран СНГ и дальнего зарубежья. Экономика здравоохранения как самостоятельный предмет преподавания уже с 1965 г. существовал в 12 зарубежных школах общественного здравоохранения, к 1971 г. этот предмет получил дальнейшее развитие и был введен уже во всех 19 существовавших в мире школах общественного здравоохранения.
Расширению образовательных возможностей способствовало выделение в 2006 г. курса в кафедру путем реструктуризации кафедры общественного здоровья и здравоохранения (решение коллегии МЗ РБ «Об итогах работы ведомственного контроля и финансово-хозяйственной деятельности организаций здравоохранения за 2005 год и задачах на 2006 год» от 29.03.2006 г. № 5/6). Таким образом, кафедра экономики и бухгалтерского учета в здравоохранении стала правопреемницей курса с одноименным названием.
В соответствии с Приказом ректора «Об оптимизации деятельности кафедры экономики и бухгалтерского учета в здравоохранении» от 30.03.2012 г. № 305 к кафедре присоединен курс медицинской информатики. Кафедра переименована в кафедру экономики и бухгалтерского учета в здравоохранении с курсом медицинской информатики. Изначально идея создания курса информатики (2000 г.) принадлежит проректору БелГИУВ по учебной работе, доценту Михалевичу П.Н. (род. 1949).
В целях приведения в соответствии с Общегосударственным классификатором Республики Беларусь 011-2009 "Специальности и квалификации" направление «Финансовый менеджмент» и повышения качества подготовки специалистов финансово-экономического профиля для здравоохранения и гармонизации номенклатуры специальностей с видами экономической деятельности по ОКРБ 005 кафедра с 01.01.2018 г. переименована в кафедру финансового менеджмента и информатизации здравоохранения.
С 1 июля 2024 года кафедра входит в состав факультета дополнительного образования работников здравоохранения института повышения квалификации и переподготовки кадров здравоохранения учреждения образования «Белорусский государственный медицинский университет»