В 1926 г. на медицинском факультете Белорусского государственного университета при кафедре госпитальной хирургии был организован курс одонтологии (стоматологии). Руководство курсом было возложено на заведующего кафедрой госпитальной хирургии, профессора М.П.Соколовского. В 1927 г. на должность заведующего курсом стоматологии избран доцент И.М.Старобинский. С 1930 года курсом заведовал Ю.К. Метлицкий, которому в 1932 г. было присвоено ученое звание доцента.
В соответствии с приказом Министра Высшего образования СССР № 185 от 2 апреля 1960 г. на базе Минского медицинского института организован стоматологический факультет.
Организацию и руководство подготовкой студентов-стоматологов обеспечивали деканы 1-5 курсов лечебного факультета: доцент кафедры истории КПСС В.В. Зубец, доцент кафедры анатомии П.И. Лобко, доцент кафедры акушерства и гинекологии П.И. Касько, доцент 2-й кафедры хирургических болезней В.Г. Астапенко, доцент кафедры туберкулеза Н.Г. Белый, доцент кафедры общей хирургии Л.И. Артишевский, ассистент кафедры физического воспитания и ЛФК Л.Н. Васильев и ассистент курса стоматологии Е.М. Ивус.
В 1963 г. курс стоматологии был реорганизован в кафедру стоматологии, а в 1964 г. - в кафедру терапевтической и ортопедической стоматологии (зав. – доцент Ю.К. Метлицкий) и кафедру хирургической стоматологии (зав. – доцент Т.В. Фокина).
В 1966 г. стоматологический факультет выделяется в отдельное структурное подразделение института. В 1966 г. деканом стоматологического факультета назначен доцент кафедры общей хирургии Л.И. Артишевский.
В 1967 г. из состава кафедры терапевтической и ортопедической стоматологии выделилась кафедра ортопедической стоматологии, которой в течение 26 лет бессменно руководил профессор Л.С. Величко. С 1993 г. кафедру возглавил его ученик, профессор С.А. Наумович.
В 1971 г. деканат стоматологического факультета возглавил доцент 1-й кафедры хирургических болезней А.А. Хартоник.
В этом же году на должность заведующего кафедрой терапевтической стоматологии избран профессор Г.П. Соснин. В 1979 г. курс стоматологии детского возраста при кафедре терапевтической стоматологии реорганизован в кафедру, которой руководил по 2001 г. профессор Э.М. Мельниченко, а с 2002 г. кафедрой стоматологии детского возраста заведует профессор Т.Н. Терехова. В 1980 г. заведующим кафедрой челюстно-лицевой хирургии назначен профессор О.П. Чудаков.
В период с 1987 г. по 1989 г. деканат стоматологического факультета возглавлял доцент кафедры ортопедической стоматологии А.В. Козел.
В 1990 г. деканом стоматологического факультета избран доцент кафедры биологической химии А.В. Колб.
С 1990 г. кафедрой терапевтической стоматологии заведует профессор П.А. Леус.
В 1997 г. факультет одним из первых среди медицинских ВУЗов стран бывшего СССР разработал и перешел на новый учебный план, одобренный Ассоциацией стоматологического образования при Всемирной Организации Здравоохранения. Это стало возможным благодаря инициативе заведующего кафедрой терапевтической стоматологии, эксперта ВОЗ, профессора П.А.Леуса. Отличием нового плана является перераспределение объема учебных часов в пользу преподавания стоматологических дисциплин. В последующем, учебный план БГМУ по специальности 'Стоматология' принят за основу на стоматологических факультетах других медицинских ВУЗов.
В 1997 г. из состава кафедр терапевтической и ортопедической стоматологии выделилась кафедра общей стоматологии (зав. – доцент Н.М. Полонейчик). В 1999 г. организована 2-я кафедра терапевтической стоматологии (зав. – доцент А.Г. Третьякович). В 2000 г. из состава кафедры стоматологии детского возраста выделилась кафедра ортодонтии (зав. – профессор Игорь Владиславович Токаревич).
В период с 2002 по 2007 г.г. деканат стоматологического факультета возглавлял зав. кафедрой общей стоматологии, доцент Н.М. Полонейчик.
В 2002 г. организована 3-я кафедра терапевтической стоматологии (зав. – профессор Л.Н. Дедова), которая в 2022 году переименована в кафедру периодонтологии. C 2005 г. 1-ой кафедрой терапевтической стоматологии руководит доцент Л.А. Казеко, которая в 2022 году переименована в кафедру консервативной стоматологии. С 2006 г. кафедрой челюстно-лицевой хирургии руководил доцент А.В. Глинник.
В 2007 г. руководство стоматологическим факультетом обеспечивал доцент кафедры общей хирургии И.Л. Бибик.
В этом же 2007 году организована кафедра хирургической стоматологии (зав. - профессор И.О. Походенько-Чудакова).
С осени 2007 года по июль 2012 деканат возглавляет профессор кафедры челюстно-лицевой хирургии А.С. Ластовка.
В июле 2012 г. деканом стоматологического факультета был назначен доцент кафедры ортопедической стоматологии С.Н. Пархамович.
На кафедрах стоматологического факультета сегодня обучается 1207 студентов-стоматологов (из них 293 на английском языке) и 177 клинических ординаторов, граждан Республики Беларусь и граждан стран ближнего и дальнего зарубежья.
Профессорско-преподавательский состав кафедр стоматологического факультета включает 271 преподавателей. В числе руководителей и преподавателей работают 23 доктора медицинских наук (из них 1 член-корреспондент НАН Беларуси) и 125 кандидатов медицинских наук. На кафедрах факультета активно ведется подготовка научно-педагогических кадров высшей квалификации, а также много внимания уделяется научной работе со студентами.
С 2021 года деканат стоматологического факультета возглавляет доцент кафедры хирургической стоматологии Шевела Татьяна Леонидовна.
С 2024 года декан стоматологического факультета Маркауцан Павел Викторович.
