В настоящее время клиническими базами кафедры являются УЗ «2-я Городская клиническая больница», УЗ «4-я Городская клиническая больница им. Н.Е.Савченко» и 432 Главный военный клинический медицинский центр МО РБ.
Ежегодно выполняется более 3000 консультаций, более 1500 операций.
Сотрудники кафедры курируют работу профильных отделений, проводят плановые обходы, консультируют и оперируют наиболее тяжелых больных, намечают план их дальнейшего обследования и лечения, а также контролируют его выполнение.
Хирурги кафедры обеспечивают внедрение современных достижений науки в лечебную практику, в частности, видеолапароскопические оперативные вмешательства при патологии гепатопанкреатобилиарной системы, реконструктивные операции на толстой и тонкой кишке, эндовенозная лазерная коагуляция при варикозной болезни, панкреатодуоденальная резекция при лечении хронического панкреатита.
Также осуществляют организационно-методическую работу, участвуют в работе комиссии по изучению летальных исходов лечебных учреждений, военно-врачебной экспертизе военнослужащих, организовывают совместно с ведущими специалистами лечебных учреждений научно-практические конференции врачей клиники.
При необходимости экстренной консультации в клинике сотрудники кафедры в любое время суток консультируют и оперируют больных.
Дважды в неделю в курируемых отделениях сотрудниками кафедры проводятся плановые обходы.
Осуществляется консультативная помощь другим лечебным учреждениям.
Сотрудниками кафедры выполняются рецензии историй болезни и проводятся патологоанатомические конференции.