Музей истории Белорусского государственного медицинского университета организован на основании приказа ректора университета от 26.09.2017 № 520.
На протяжении последующего периода работниками университета проводилась интенсивная организационно-методическая и поисково-исследовательская работа, позволившие наладить материально-техническую часть, а также собрать в фонд музея около 1000 оригинальных предметов, в том числе из семейных архивов акад. Д. М. Голуба, акад. В. А. Леонова, акад. И. Д. Мишенина, П. Я. Герке, акад. А. Ф. Смеяновича, член-корр. Т. В. Бирич, член-корр. С. М. Мелких, профессоров Е. В. Барковского, А. С. Крюка, О. С. Мишарева, Д. В. Полешко, Г. П. Соснина, А. В. Шотта, Г. Х. Довгялло, доцентов А. А. Астапова, А. Л. Навроцкого, П. И. Касько, Е. И. Николаевой, Л. Е. Тарановича, Н. М. Полонейчика, министра здравоохранения БССР И. А. Инсарова и других работников, и выпускников МГМИ/БГМУ.
13 декабря 2021 г. состоялось торжественное открытие первой очереди экспозиции музея, посвящённой становлению и развитию медицинского факультета БГУ, Белорусского/Минского государственного медицинского института период с 1921 по 1960 гг.
Тематически, экспозиция разделена на четыре раздела:
В первом разделе отражена деятельность медицинского факультета БГУ, Белорусского (Минского) медицинского института в 1920-1930-е годы. Освещаются предпосылки и пути создания медицинского факультета БГУ, его реорганизация в самостоятельное учреждение – Белорусский медицинский институт. При помощи уникальных экспонатов, показывается развитие материальной-технической базы института, формирование кафедр и научно-педагогических школ, организация учебного процесса.
Второй раздел построен на документах, фотографиях и наградах преподавателей и студентов БГМИ, ветеранов Великой Отечественной войны. В их числе Герои Советского Союза Е. В. Клумов и Н. В. Троян, праведники народов мира Е. И. Николаева и М. И. Манова, подпольщица Н. М. Моисеева.
Деятельности Белорусского/Минского медицинского института в эвакуации и послевоенный период (1943-1960) посвящен третий раздел экспозиции. Его экспонаты дают представление о восстановлении БГМИ в Ярославле, его реэвакуации, освещают вклад профессорско-преподавательского состава и студентов в восстановление института и белорусского здравоохранения в послевоенные десятилетия. В отдельных витринах сосредоточены материалы ректоров – З. К. Могилевчика и И. М. Стельмашонка. Интерес представляет оборудование и наглядные пособия, которые использовались в учебном процессе и научно-исследовательской работе в 1940-1950-е годы.
В четвертом разделе собраны материалы, отражающие зарождение студенческих строительных отрядов, участие студентов в спортивной, культурно-массовой и других видах общественно-полезной деятельности
Расширяет экспозицию использование мультимедийного стенда, где представлены сведения о ветеранах Великой Отечественной войны, работниках, удостоенных почетных званий и высших государственных наград, выпускниках МГМИ/ БГМУ за 100-лет, почетных докторах БГМУ; отражены достижения университета, страницы истории, воспоминания старейших работников.