Transcription-associated mutational pressure in the Parvovirus B19 genome: Reactivated genomes contribute to the variability of viral populations // Journal of Theoretical Biology 435 (2017) 199–207
Vladislav Victorovich Khrustalev, Marina Anatolyevna Ermalovich, Judith M. Hübschen, Tatyana Aleksandrovna Khrustaleva
In this study we used non-overlapping parts of the two long open reading frames coding for nonstructural (NS) and capsid (VP) proteins of all available sequences of the Parvovirus B19 subgenotype 1a genome and found out that the rates of A to G, C to T and A to T mutations are higher in the first long reading frame (NS) of the virus than in the second one (VP). This difference in mutational pressure directions for two parts of the same viral genome can be explained by the fact of transcription of just the first long reading frame during the lifelong latency in nonerythroid cells. Adenine deamination (producing A to G and A to T mutations) and cytosine deamination (producing C to T mutations) occur more frequently in transcriptional bubbles formed by DNA "plus" strand of the first open reading frame.
Mutational Pressure in Zika Virus: Local ADAR-Editing Areas Associated with Pauses in Translation and Replication
Vladislav V. Khrustalev, Tatyana A. Khrustaleva, Nitin Sharma and Rajanish Giri
Zika virus (ZIKV) spread led to the recent medical health emergency of international concern. Understanding the variations in virus system is of utmost need. Using available complete sequences of ZIKV we estimated directions of mutational pressure along the length of consensus sequences of three lineages of the virus.
In Silico Study of Morphine-Like Effects of Ethanol Intake: Docking of Acetaldehyde Conjugates with Monoamines to the Mu-Opioid Receptor
Khrustalev V.V., Lelevich S.V., Khrustaleva T.A., Skorobogatiy M.V. and Demenchuck E.A.
Acetaldehyde produced after the ethanol intake forms conjugates with monoamines. Those conjugates are thought to be able to bind mu-opioid receptors and cause morphine-like effects. The aim of this study was to check the ability of acetaldehyde conjugates with dopamine (salsolinol), serotonin, tryptamine and tryptophan, as well as their enantiomers and derivatives to bind mu-opioid receptor structure available in the Protein Data Bank ( using the Docking Server ( and the FlexX method.
Magnesium and manganese binding sites on proteins have the same predominant motif of secondary structure
V.V. Khrustalev, E.V. Barkovsky, T.A. Khrustaleva
Manganese ion (Mn2 þ) can substitute magnesium ion (Mg2 þ) in active sites of numerous enzymes. Binding sites for these two ions have been studied in two sets of protein 3D structures from the Protein Data Bank with the homology level lower than 25%. The structural motif “beta strand – binder – random coil” is predominant in both Mn2 þ and Mg2 þ coordination spheres, especially in functionally relevant ones.
The part of a long beta hairpin from the scrapie form of the human prion protein is reconstructed in the synthetic CC36 protein
V.V. Khrustalev, T.A. Khrustaleva, Kamil Szpotkowski, V.V. Poboinevand, K.Y. Kakhanouskaya
Mechanisms of beta sheet formation by the human prion protein are not clear yet. In this work, we clarified the role of the region containing C-half of the second helix and N-half of the third helix of that protein in the process of alpha helix to beta sheet transition.
Unusual nucleotide content of Rubella virus genome as a consequence of biased RNA-editing: comparison with Alphaviruses
V.V. Khrustalev, E.V. Barkovsky
The usage of cytosine in third codon positions of 22 complete Rubella virus genomes (52.4%) is significantly higher than the usage of guanine (28.9%), adenine (6.9%) and uracil (11.8%).
Structural and antigenic features of the synthetic SF23 peptide corresponding to the receptor binding fragment of diphtheria toxin // Molecular Immunology, 2015, с.235-244
T.A. Khrustaleva, V.V. Khrustalev, E.V. Barkovsky, V.L. Kolodkina, A.A. Astapov
Synthetic vaccines were proposed about thirty years ago as an alternatives to vaccines produced from bacterial cultures. The first target for synthetic vaccine development was diphtheria toxin (Audibert et al., 1981, 1982).
Local Mutational Pressures in Genomes of Zaire Ebolavirus and Marburg Virus
V.V. Khrustalev, E.V. Barkovsky, T. A. Khrustaleva
Heterogeneities in nucleotide content distribution along the length of Zaire ebolavirus and Marburg virus genomes have been analyzed.
Structural and antigenic features of the synthetic SF23 peptide corresponding to the receptor binding fragment of diphtheria toxin // Molecular Immunology 63 (2015) 235–244
T. A. Khrustaleva, V. V. Khrustalev, E. V. Barkovsky, V. L. Kolodkina, A. A. Astapov
The SF23 peptide corresponding to the receptor binding fragment of diphtheria toxin (residues 508–530) has been synthesized.
Opposite nucleotide usage biases in different parts of the Corynebacterium diphtheriae spaC gene // Int. J. Bioinformatics Research and Applications, Vol. 11, No. 4, 2015
V. V. Khrustalev, E. V. Barkovsky, V. L. Kolodkina, T. A. Khrustaleva
In this work we described a bacterial open reading frame with two different directions of nucleotide usage biases in its two parts. The level of GC-content in third codon positions (3GC) is equal to 40.17 ± 0.22% during the most of the length of Corynebacterium diphtheriae spaC gene. However, in the 3'-end of the same gene (from codon #1600 to codon #1873) 3GC level is equal to 64.61 ± 0.91%. Using original methodology ('VVTAK Sliding window' and 'VVTAK VarInvar') we approved that there is an ongoing mutational AT-pressure during the most of the length of spaC gene (up to codon #1599), and there is an ongoing mutational G-pressure in the 3'-end of spaC. Intragenic promoters predicted by three different methods may be the cause of the differences in preferable types of nucleotide mutations in spaC parts because of their autonomous transcription.
Стволовые клетки. Перспективы их применения в медицине. // ГУ НИИ эпидемиологии и микробиологии МЗ РБ, УО «Белорусский государственный медицинский университет».
Квачева З.Б., Вотяков В.И., Титов Л.П., Мезен Я.Я., Корень С.В., Антоненко К.В., Хватова Л.А.
В статье обобщены имеющиеся в литературе данные о стволовых клетках организма человека, их функциях, получении и перспективах, применения в медицине.
Стабилизация глюкозо-6-фосфат-дегидрогеназы кофактором II субстратом в ультразвуковом поле. // Институт биоорганической химии НАН Беларуси.
Карасёва Е. И., Метелица Д.И.
Целью настоящей работы было кинетическое исследование влияния субстрата(GP) и кофактора(NADP+) GPDH на константы скорости ее инактивации в водных растворах под воздействием повышенной температуры и ультразвука низкой(27 кГц)и высокой(880 кГц)частоты и определение активационных характеристик этих процессов. В качестве количественных параметров для описания термической и ультразвуковой инактивации GPDH и ее комплексов с GP и NADP+ использованы предложенные нами ранее эффективные константы скорости первого порядка: кин - константа суммарной(общей) инактивации, К*ин - термоинактивации и Кин(уз) - ультразвуковой инактивации фермента, которая вычислялась как разница кин -К*ин при каждой из заданных температур в интервале 36-47°С. Адекватность такого подхода показана нами ранее при сонолизе GPDH и других ферментов(каталазы, уреазы, пероксидазы хрена, тиреоид-пероксидазы человека), изученных в нашей лаборатории.
Peroxidase-catalyzed co-oxidation of 3,3',5,5'-tetramethylbenzidine in the presence of substituted phenols and their polydisulfides.// Journal of Inorganic Biochemistry 98 (2004), 1-9.
Metelitza D.I. , Karasyova E.I., Grintsevich E.E., Thorneley R.N.F.
The steady-state kinetics of the horseradish peroxidase (HRP)-catalyzed oxidation of 3,3',5,5'-tetramethylbenzidine (TMB) has been studied in the presence of 2-amino-4-nitrophenol (ANP), gallic acid (GA) or 4,4/-dihydroxydiphenylsulfone (DDS) and their polydisulfides poly(ADSNP), poly(DSGA), poly(DSDDS) at 20 °C in 10 mM phosphate buffer, pH 6.4, supplemented with 5-10% dimethylformamide.
Лектины лекарственных растений дикорастущей флоры Беларуси: перспективы использования. // Вестник Фонда фундаментальных исследований, № 2.
Канделинская О.Л., Грищенко Е.Р., Обуховская Л.В., Мастибротская И.П., Масловский О.М., Таганович А.Д., Деина Е.А., Принькова Т.Ю., Шман Т.В., Шуканова Н.А., Голубков В.В.
Цель работы – изучение активности лектинов в различных органах некоторых лекарственных растений дикорастущей флоры Беларуси и анализ ресурсного потенциала наиболее перспективных представителей.
Инициирование и ингибирование свободнорадикальных процессов в биохимических пероксидазных системах (обзор). // Институт биоорганической химии НАН Беларуси, Минск.
Метелица Д.И., Карасёва Е.И.
Обзор посвящен роли кислородных и пероксидных комплексов в монооксигеназных и моделирующих их системах, в пероксидазных и "псевдопероксидазных" процессах. Рассмотрены маршруты превращения этих промежуточных комплексов по одноэлектронному (свободнорадикальному)и двухэлектронному(гетеролитическому) механизму. Проведен анализ сопряженного пероксидазного окисления ароматических аминов и фенолов и рассмотрены количественные характеристики ингибирования и активации пероксидазных реакций: окисление пероксидазных хромогенных субстратов(АБТС, ФДА и ТМБ)в присутствии ингибиторов фенольной природы и полидисульфидов замещенных фенолов охарактеризовано константами ингибирования Кi в мкМ, а активация пероксидазного окисления тех же субстратов - степенью (коэффициентом) активации α; в М-1, определенным для 2-аминотиазола, меламина, тетразола и его 5-замещенных производных. Приведены примеры практического использования пероксидных ферментных и модельных систем в окислении органических соединений, химическом и иммуноферментном анализе многих объектов и в тест-системах общей антиоксидантной активности биологических жидкостей.
Ингибиторы перекисного окисления липидов с внутримолекулярным синергизмом. // Белорусский государственный университет, Минский государственный медицинский институт.
Лосев Ю.П., Федулов А.С., Мезен Н.И.
Перекисное окисление липидов(ПОЛ) (свободно-радикальная патология) приводит к мембранодеградации и сопровождает развитие различных заболеваний(лучевая болезнь, атеросклероз, ишимическая болезнь сердца и мозга, онкологические заболевания, различного типа отравления и т.д.). Снижение ПОЛ обеспечивают специальные вещества — ингибиторы, препятствующие накоплению токсичных продуктов окисления.
Ультразвуковая инактивация глюкозооксидазы в водных растворах. // Институт биоорганической химии НАН Беларуси, Минск, Беларусь.
Карасёва Е.И., Тарун Е.И., Метелица Д.И.
Цель работы - количественная кинетическая характеристика термической и ультразвуковой инактивации глюкозооксидазы A. niger в водных растворах при разных температурах(37-59°С)и рН и воздействии низкочастотного(27 кГц) и высокочастотного(2.64 МГц) ультразвука в непрерывном режиме, а также защита фермента от УЗ-инактивации.
Изменение уровня фактора ангиогенеза – VEGF и фактора межклеточной адгезии – ICAM-1 в сыворотке крови больных раком тела матки. // ГУ «РНПЦ онкологии и медицинской радиологии им. Н.Н. Александрова», г. Минск, УО «Белорусский государственный медицинский университет», г. Минск.
Таганович А.Д., Прохорова В.И., Принькова Т.Ю., Шишло Л.М.
Иммуноферментным методом определено содержание фактора ангиогенеза – VEGF и фактора межклеточной адгезии – ICAM-1 в сыворотке крови 34 пациенток, страдающих раком тела матки, и 20 клинически здоровых лиц. Обнаружено, что концентрация изучаемых опухолеассоциированных белков в сыворотке больных раком тела матки была выше значений, наблюдаемых у клинически здоровых лиц. При распространенном опухолевом процессе уровень изучаемых белков повышался в большей степени по сравнению с нераспространенным заболеванием. Полученные данные свидетельствуют о том, что оба этих фактора перспективны к дальнейшей разработке в качестве маркеров прогнозирования опухолевого роста.
Биоантиоксидантная активность 3,5-ди-трет- бутилпирокатехина и его влияние на гипоксию, воспалительный процесс, болевой синдром и ожоги. // УО «Белорусский государственный медицинский университет».
Шадыро О.И., Шилов Г.Н., Тимощук В.А., Власова В.И., Федулов А.С., Мезен Н.И.
Целью настоящей работы было установление наличия биоантиоксидантной активности у стерически затрудненного производного двухатомного фенола -3,5-ди-трет-бугилпирокатехина (3,5>ДТБП). Следующим этапом было проведение экспериментов на животных, направленных на изучение корреляции между антиокислительным эффектом соединения и его защитным физиологическим действием при моделировании различных патологичесих состоянии организма: гипоксии ожоге, воспалении, болевой реакции. В каждом опыте 3,5-ДТБП использовали в наиболее эффективной концентрации, установленной нами экспериментально.
Protective effect of a new t-3 synthetic ant1oxidant in hypoxic damage of astrocytes in vitro. // First International Update on Neuro-Anesthesia Neuro-lntensiue Care, December 12, 1997.
Fedulov A., Kvacheva Z, Mezen N., Lobanok E., Shukanova N., Ilkevitch Yu., Shadyro O.
The cerebral injury, caused by ischemia, which includes severe hypoxia and failure to remove toxic metabolic products, is of multifactor character. There is an ultrastructural evidence that astrocytes swelling is a nearly and primary event following the cerebral ischemia. The mechanisms of astrocytes damage has not yet cleared out. One of the main factors of hypoxia cell damaging effect is an increase in the processes of lipid freeradical oxidation(FRO). The efficacy of antioxidant in hypoxia with different etiology has been demonstrated. Proceeding from this, the studies, targeted at search and development of antioxidants, the FRO inhibitors, are considered to be very topical. The present investigations were focused on a protective effect of T-3 synthesized compound(a derivative from two-atom phenols)on astrocytes, cultured under hypoxia conditions.
Особенности изменения функциональной активности альвеолярных макрофагов при контакте с сигаретным дымом. // УО «Белорусский государственный медицинский университет».
Девина Е.А., Принькова Т.Ю., Таганович А.Д.
Целью данного исследования явилось изучение влияния экстракта сигаретного дыма(ЭСД)на жизнеспособность альвеолярных макрофагов, их фагоцитарную активность и способность к генерации оксида азота.
Влияние сигаретного дыма на компоненты оксидантно-антиоксидантной системы в альвеолярных макрофагах. // УО «Белорусский государственный медицинский университет».
Девина Е.А., Принькова Т.Ю., Таганович А.Д.
Целью данного исследования явилось изучение влияния сигаретногодыма на продукцию АФК, уровень ПОЛ и активность антиоксидантных ферментов в альвеолярных макрофагах(АМ)в зависимости от концентрации смол в СД и длительности их воздействия.
Перспективы использования антиоксидантов для лечения хронической обструктивной болезни легких (ХОБЛ). // Кафедра биологической химии и кафедра клинической фармакологии, УО «Белорусский государственный медицинский университет».
Таганович А.Д., Девина Е.А., Принькова Т.Ю., Таганович Н.Д.
В данной статье обсуждаются подходы к использованию антиоксидантов в терапии ХОБЛ.
Сравнительная оценка антиоксидантного действия ресвератрола и эпигаллокатехин галлата при окислительном стрессе, индуцированном сигаретным дымом в альвеолярных макрофагах. // УО «Белорусский государственный медицинский университет».
Девина Е.А., Таганович А.Д.
Цель: изучить эффект ресвератрола и ЭГКГ на показатели оксидантно-антиоксидантного состояния альвеолярных макрофагов(АМ)в норме и при воздействии экстракта сигаретного дыма(ЭСД), и оценить целесообразность их использования для предотвращения изменений, вызванных сигаретным дымом.
Влияние N-ацетилцистеина на функциональную активность и показатели метаболизма изолированных альвеолярных макрофагов, контактировавших с экстрактом сигаретного дыма. // УО «Белорусский государственный медицинский университет».
Девина Е.А., Принькова Т.Ю., Таганович А.Д.
Цель исследования – изучить эффекты N-ацетилцистеина на фагоцитарную активность, показатели оксидантно-антиоксидантного состояния и метаболизм оксида азота в альвеолярных макрофагах в условиях воздействия сигаретного дыма.
Изменения фосфолипидного и белкового компонентов бронхоальвеолярной жидкости в условиях экспериментальной гипероксии. // УО «Белорусский государственный медицинский университет», г. Минск.
Котович И.Л., Рутковская Ж.А., Стовба А.А., Кончиц Е.С., Таганович А.Д.
Целью настоящего исследования стало изучить в эксперименте характер изменения фосфолипидного состава сурфактанта и оценить степень окислительного повреждения липидов и белков в бронхоальвеолярном пространстве в динамике длительной гипероксии.
In silico directed mutagenesis using software for glycosylation sites prediction as a new step in antigen design. // Journal of Integrated OMICS. – 2012. – Vol.2. – P. 31-36.
Vladislav V.K., Barkovsky E.V.
In silico directed mutagenesis with the aim to estimate consequences of mutational pressure on number of N- and O-glycosylation sites has been proposed as an important step in antigen design. Using this kind of methodology one is able to estimate probabilities at which N- and O-glycosylation sites can be destroyed and created due to one-step missense mutations in the subsequent gene.
Активность глутатионпероксидазы, глутатионредуктазы и уровень глутатиона восстановленного в печени, мозге и эритроцитах крыс в возрастном аспекте. // Ключови въпроси в съвременната наука 2011: материали за 7-а международна научна практична конференция. – София, 17-25 април 2011 / «Бял ГРАД-БГ» ООД; отв. ред. М.Т. Петков. − Республика България, гр. София, 2011. − Том 33. Биологии. – С. 105−106.
Тарасевич И.С., Ринейская О.Н., Глинник С.В., Прокопчик К.Г.
Целью исследования явилось изучение изменений активности ГП, ГР, уровня восстановленного глутатиона в тканях печени, мозга и эритроцитах при старении экспериментальных животных (крыс).
Изменчивость фенетической структуры популяций бурых лягушек витебской области. // Вопросы естествознания: сб. науч. статей. Выпуск 5 / Белорус. гос. пед. ун-т им. М. Танка; под общ. ред. М.Г. Ясовеева. – Минск: Право и экономика, 2010. – С. 71–73.
Тарасевич И. С., Хандогий А. В.
Основная цель исследования – провести сравнительный анализ изменчивости некоторые фенетических особенностей структуры популяций бурых лягушек в биоценозах Витебской области.
Характеристика гормонального и прооксидантно-антиоксидантного статуса крыс при иммобилизационном стрессе . // Труды молодых ученых 2010: сб. науч. работ / Белорус. гос. мед. ун-т; под общ. ред. С.Л. Кабака. – Т. 78 Минск: БГМУ, 2010. – C. 20−24.
Глинник С.В.
Цель исследования: изучение влияния 3-х часового иммобилизационного стресса на гормональный и прооксидантно-антиоксидантный статус крыс.

 1   2   3  следующая →